大成殿、儀門、崇聖祠三つの建物と東廡、西廡が落成してからは、寄付が滞りがちとなり、財政難からその後の建設工事は中断されました。民国二十四年（一九三五年）、台北の名士黄贊鈞、辜顯栄などが工事の再開を提案し、再び募金が始められ、材料を購入し、大工を集め始めましたが、この時には本来の設計者である王益順は泉州で逝去した後で、工事はやむなく台湾の大工に任せることになりました。まず、櫺星門から着工され、礼門、義路、黌門、泮宮、泮池、万仞宮牆と再建が続きました。民国二十八年（一九三九年）にはすべての工事が終わり、現在見られる規模を備えるようになったのです。前後二回にわたる募金では二十六万元余りを集め、総面積は四千一百六十八坪、建坪は一千六百坪です。

完成後数年で第二次世界大戦が勃発し、日本人は中国の古代豊かな祭典を禁止し、代わりに日本の靖国神社の祭礼を強制しました。しかし、これも一時的なことで、民国三十四年（一九四五年）台湾は中国に戻ったのです。